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通常情况下，花色苷的基本C骨架会被一个或者多个糖昔以及酞基化糖昔联接，因而具有将强的极性。传统花色苷的提取方法主要根据其极性采取适当的溶剂进行提取，目前研究报道较多的花色苷提取溶剂主要分为水、亲水性有机溶剂以及亲脂性有机溶剂。其中亲水性有机溶剂主要包括甲醇、乙醇、乙睛以及丙酮等，主要用来提取水溶性花色苷；亲脂性有机剂主要包括二氯甲烷、乙酸乙酷、石油醚、氯仿、苯、乙醚等，主要用来提取脂溶性花色苷。为防止花色苷的降解，提高花色苷提取率，常在提取溶剂中加入适量无机酸或有机酸以降低溶剂pH值。常用无机酸主要有盐酸、硫酸、亚硫酸和碳酸等;常用有机酸主要有甲酸、醋酸、柠檬酸和酒石酸等。随着科学技术的迅猛发展，像超临界流体萃取、微波辅助提取、超声波提取、微生物破壁、酶解等新兴提取方法正改变着传统提取方式，使花色苷提取工艺向着生产环保、节约能源、提取率高、操作简便等方向发展。