化学合成法：化学合成法可以通过精心设计基质合成特殊结构的低聚糖。随着近几年糖化学的兴起，壳寡糖的合成也日益受到研究者的关注。利用几丁质酶制备壳聚糖和壳聚糖的杂环衍生物，而且还具有生物活性。FridmanMicha等运用一锅煮的方法制备了壳寡糖三糖和四糖，产率在51%～80%之间。这种方法的优点就是可以根据自己的需要来设计寡糖。2.物理制备法1）超声波法和微波法：在上世纪80年代末期，我国学者王将甲壳质脱乙酰化后，溶于乙酸溶液中，在60℃条件下用超声波处理，发现壳聚糖粘度，而降解过程中对氨基的含量没有影响。微波辐射法近年来也引起了人们的研究兴趣，将聚合度为3～150，相对分子量在600～3Chemicalbook0000之间的壳聚糖加入含有NaCl或KCl或CaC12的电解质稀酸溶液中，以480～800W的微波辐射能量，降解反应3～12min，冷却至室温，再用2M的NaOH液中和得淡黄色絮状沉淀；再在4℃冷藏柜中沉淀30min，抽滤，所得滤饼再在60℃下烘干，粉碎，即得甲壳低聚糖化合物。此方法能够降低能耗，减少污染，节省时间和原料，具有产业化前景和广泛的市场潜力。2）γ射线照射下辐射降解：辐射降解是在放射性射线照射下，使壳聚糖分子产生电离或激发的物理效应，进而导致分子链断裂。用放射性钴在大气和真空下照射相对分子量为2.74×105的壳聚糖，得到一系列低聚合度壳聚糖，而且不但没有破坏氨基含量，反而含量增加。