我国关于桅子蓝色素的研究起步较晚，国内关于桅子蓝色素制备的报道不多。桅子蓝色素的制备方法可以归纳总结为两种：一种是在培养基中直接加入粉碎后的桅子果实，将发酵水解与合成一步完成，此种方法不但产品质量不高，而且还造成了桅子黄色素的浪费；另一种方法被称为两步法，将桅子蓝的水解与桅子蓝色素的合成分开，以提高桅子蓝色素的质量。虽然制备桅子蓝色素有两种不尽相同的方法，但是不难看出桅子蓝色素的制备过程中必不可缺的两步：一步是水解，就是在酶做催化剂的条件下将桅子普水解为桅子普元;另一步是合成，就是在一定条件下桅子苷元与氨基酸反应生成桅子蓝色素。在直接发酵法中，水解与合成是同时进行的，这种方法虽然操作简单，但是得到的产品多灰暗泛绿或偏紫并且收率低。两步法在工艺上对直接发酵法进行改进，将桅子苷的水解与合成桅子蓝色素分开进行，既可以提高桅子蓝的品质有增加了收率。但是两步法是采用游离酶水解，在水解过程还属于间歇操作，这样不利于桅子蓝色素的连续化、工业化生产