胭脂红的毒性为小鼠经口毒理测试（FAO/WHO）LD50：> 19.3g/kg。

1.胭脂红作为一种偶氮化合物在体内经代谢生成β - 萘胺和α - 氨基-1- 萘酚等具有强烈致性的物质，胭脂红与欧盟标准禁用的苏丹红Ⅰ同属于偶氮类色素, 偶氮化合物在体内可代谢生成致突变原前体，芳香胺类化合物，芳香胺被进一步代谢活化后成为亲电子产物与DNA和RNA结合形成加合物而诱发突变   。

2.胭脂红可被氧化产生自由基，进而再与体内物质代谢产生一系列活性氧( react ive oxygen species, ROS ), ROS攻击DNA造成DNA氧化损伤  。

3.胭脂红毒理学实验显示其具有一定的致和致突变作用  。

4.合成色素胭脂红在加工过程中会受到砷、铅、铜、苯酚、苯胺、乙醚、氯化物等物质的污染，会对人体造成潜在的危害。

5.胭脂红对泥鳅的毒性小，但是胭脂红可以不同程度地引起泥鳅微核细胞率和核异常率等遗传指标的上升，表明胭脂红对泥鳅红细胞具有一定的致突变作用，具有一定的遗传毒性