应用领域在医药上的应用：主要用于五官科多种粘膜如副、、急、、、渗出性，以及皮肤科如、、等，亦用于性、性、等。本品与药物同用效果更好。在生物技术中应用：溶菌酶具有破坏细菌细胞壁结构的功能，用溶菌酶处理G+细菌可以在破坏细胞壁后得到原生质体，所以广泛用于生物技术中，成为基因工程、细胞工程中细胞融合操作必不可少的工具酶。在水产品和肉类制品中的应用：针对溶菌酶无毒、无害的特性，同时对G+细胞壁的分解作用，应用于水产品和肉类制品中，在保证食品原有营养成分不受损失的前提Chemicalbook下，可以对水产品和肉类制品起到保鲜和防腐作用；利用溶菌酶与氯化钠和亚硝酸盐联合应用，可以延长肉制品的保质期，其防腐效果比单独使用时效果更好；试验用0.05%的溶菌酶与植酸聚合磷酸盐、甘氨酸等配合使用，作为防腐剂和保鲜剂可以对海产品和水产品延长储存期。在其他食品中的应用：奶油蛋糕是容易腐败变质的食品之一，在糕点中加入溶菌酶，可防止微生物引起的腐败变质现象发生；将溶菌酶应用于食物的保鲜中，其效果也极为明显。同时根据溶菌酶无毒、无害且有保健作用，有抗和增强抗生素的效力，以及促进及止血和组织再生作用，现在有人尝试在食品中作为添加剂增强食物的保健。