野生三文鱼生存环境竞争十分激烈，为了活下去而疲于奔命，3年之后才能成熟，因此肌肉组织发达，脂肪含量少，肉质柔软紧实，有种吃瘦肉的感觉；养殖三文鱼缺少自然竞争环境和运动空间，饲料都是由高脂肪、高蛋白组成，一般都膘肥体壮，1年不到就可以迅速长到20多斤，鱼体肥嫩富含脂肪，鱼肉上可以看到非常明显的白色脂肪线，口感则比较松软。野生三文鱼的营养略高于养殖的。实验检测发现，人工养殖三文鱼营养也不错，氨基酸组成全面，氨基酸总量和呈味氨基酸的质量分数都相当高，是一种营养价值很高的食品。

大西洋鲑鱼通常在春夏季节的温暖水流中发育生长，需要3年才能长大，无法满足市场的需求。科学家使用技术手段，在大西洋鲑鱼的受精卵中植入太平洋奇努克三文鱼生长激素基因，以及大洋鳕鱼抗冻蛋白基因。大洋鳕鱼的抗冻蛋白能让转基因鱼在寒冷环境中继续分泌生长激素，进而达到生长周期缩短的目标。转基因三文鱼的生长周期可缩短为18个月，且个头比普通鱼更大。美国食品药品管理局（FDA）在2010年就已完成转基因三文鱼的食品安全评估，目前已经在美国和加拿大获得批准上市，可以放心食用。