畜牧业

在饲料中添加半纤维素酶可以促进动物对脂肪和蛋白质的消化及吸收，提高饲料的转化率；半纤维素酶与蛋白酶组成的酶制剂还能提高猪仔的日增重，降低猪仔死亡率。

食品工业

半纤维素酶可以分解咖啡中的半乳糖为低聚糖，大大降低咖啡的粘度，从而降低了速溶咖啡的生产成本；半纤维素酶可以水解谷物面粉中的木聚糖产生木寡糖从而大大改善了面包的质地结构和松软度。

复合酶的一个非常重要的功能是参与的工作。以蛋白酶为代表，可以将进入的大分子（淀粉和蛋白质）降解为小于15微米的小分子，以便于充分吸收。淀粉不能被直接吸收，而酶可以将淀粉水解为麦芽糖或更进一步水解为葡萄糖等可以吸收的小分子。不同的酶分解不同的食物底物。在草食性反刍动物的中存在一些可以产生纤维素酶的细菌，纤维素酶可以分解植物细胞壁中的纤维素，从而提供可被吸收的养料。